孢子粉的破壁方法目前主要两类，一是物理法，二是生物酶解法，酶法破壁的优势在于条件温和，孢子内含成分保留全；但是酶解时间太长，破壁率不达标，实际生产还需借助物理法联合运用，才能达到理想破壁率，同时酶解产物目前也没有做过安全性研究分析，且都残留到孢子粉里，降低了孢子粉的纯度。

因此目前绝大多数企业采用物理法破壁，低温物理保持孢子活性。